Sciences de la vie

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Tests de dépistage du SARS-CoV-2

Préparation des échantillons pour les diagnostics RT-PCR en ambulatoire

Intensification des tests de diagnostic pour le dépistage du SRAS-CoV-2. Selon Christian Drosten*, virologiste à l’hôpital de la Charité à Berlin, l’évolution modérée de l’épidémie en Allemagne à ce jour est due à ces tests de laboratoire. De nombreux laboratoires ont donc maintenant besoin d’appareils fiables pour préparer des échantillons en toute sécurité, notamment en prévision des tests RT-PCR.

Trois phases de préparation des échantillons pour le test RT-PCR pour 2019-nCoV

L’OMS a publié des directives à l’intention des laboratoires qui effectuent ces tests. Pour obtenir des résultats sûrs pour le 2019-nCoV après un prélèvement nasal ou oropharyngien, l’échantillon doit être nettoyé minutieusement au préalable.

Grâce aux équipements de laboratoire IKA pour le secteur des sciences de la vie, les différentes étapes de la préparation des échantillons peuvent être réalisées de manière fiable et rapide. Surtout, les appareils IKA peuvent être utilisés par tout le monde y compris par les employés qui, en raison de la situation actuelle, peuvent avoir besoin d’être formés et familiarisés rapidement aux tests de laboratoire de diagnostic médical. Avant que le test de dépistage du SRAS-CoV-2 puisse être effectué, trois phases de préparation des échantillons sont nécessaires.

  • Préparation de l’échantillon
    Lorsque les échantillons sont préparés, les cellules de la muqueuse buccale sont centrifugées, isolées et mélangées pour créer des suspensions cellulaires. Ici, comme dans toute la biologie moléculaire, il faut des pipettes avec des filtres sans RNAse/ DNAse, car l’ARN est détruite très rapidement par des enzymes, comme la RNAse. Le filtre empêche aussi efficacement la contamination croisée. Selon le type d’échantillon, on peut également utiliser des pipettes plus grandes que celles recommandées par l’OMS. La nouvelle série PETTE d’IKA offre l’avantage supplémentaire d’une conception ergonomique. Le pipetage fréquent lors des tests quotidiens est donc un jeu d’enfant. En outre, des centrifugeuses et des agitateurs sont également utilisés.

  • Lyse
    Les enveloppes des virus sont alors cassées Ici aussi, le pipetage en toute sécurité est la panacée. Pour le contrôle de la température, des agitateurs thermiques de haute qualité avec des embouts de 1,5 ml ou de 2 ml, tels que le Matrix Orbital Delta F1.5 ou F2.0 d’IKA, sont recommandés.

  • Purification et extraction
    Pour la purification et l’extraction, il faut des pipettes fixes ou, idéalement, variables, car différents volumes sont recommandées par l’OMS (2, 10, 200 et 1000 µl). L'échantillon fragmenté est alors à nouveau centrifugé. La centrifugeuse midi IKA G-L, par exemple, convient aux processus de lavage et de séparation de cette phase.

    Le test à proprement dit ne peut être réalisé qu’après ces trois phases préparatoires. Pour le test, l’ARN du coronavirus éventuellement présent doit d’abord être réécrit en ADNc et reproduit dans un thermocycleur jusqu’à un nombre détectable de 10^9. La reproduction a lieu à l’aide de ce qu’on appelle des « amorces » (fragments d’ADN correspondant à l’ARN du virus) qui, si l’ARN ou l’ADNc du coronavirus est présent, déclenchent le processus de reproduction. Les amorces du matériel génétique du coronavirus fabriqué en laboratoire sont ajoutées à l’échantillon pour savoir si le matériel génétique du coronavirus peut s’attacher à l’échantillon du patient (= positif) ou non (= négatif).

    Test de dépistage du SRAS-CoV-2

    Step1_Covid
* Source : https://www.spiegel.de/wissenschaft/mensch/corona-krise-virologe-liefert-erste-erklaerungen-zu-niedrigen-todeszahlen-in-deutschland-a-c8fef5d1-9c8e-4e9d-b8cc-3f85c6b00282 [requis : 25 mars 2020]

Des résultats optimaux peuvent être obtenus avec ces appareils :

Thermoshakers
Centrifuges
Dry Block Heaters
Pipettes
Life Sciences
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